Музей-заповедник создан на основании постановления Кабинета Министров Республики Татарстан от 31.01.1994 г. № 39 «О создании Государственного историко-архитектурного и художественного музея-заповедника «Казанский Кремль» во исполнение Указа Президента Республики Татарстан от 22.01.1994 г. № 47 «О создании Государственного историко-архитектурного и художественного музея-заповедника «Казанский Кремль». Территория - 13,45 га, охранной зоны - 115 га.
Музей-заповедник является объектом исторического и культурного наследия мирового, федерального (общероссийского) наследия и особо ценным объектом культурного наследия Республики Татарстан. В 1998 г. представлен и в 2000 г. включен в Список всемирного культурного и природного наследия (ЮНЕСКО).

В состав музея-заповедника входят:
Городище «Казанский Кремль» (X-XVI вв.) - культурный слой болгарского укрепленного торгового поселения ( Х - первая половина XIII вв.), центра Казанского княжества в составе Золотой Орды (XIII - первая половина XV вв.), столицы Казанского ханства (1438-1552 гг.) с архитектурно-археологическими фрагментами земляных, деревянных и каменных укреплений X-XVI вв., каменных сооружений XV-XVI вв. (ханских мавзолеев, минарета или дозорной башни), моста и каменной мостовой XII-XVI вв.
Каменно-кирпичный кремль (XVI-XVIII вв.) - крепость Казанский Кремль, выстроенная на уровне самых высоких требований того времени, была одной из лучших в России и считалась неприступной. Стены и башни построены в 1556-1562 гг. псковскими мастерами во главе с Иваном Ширяевым и Постником Яковлевым по прозвищу «Барма». Целиком в камне и кирпиче стены и башни кремля были достроены в конце XVI-XVIII вв. Из 13 крепостных башен кремля сохранились 8: Спасская и Тайницкая проездные, Воскресенская, Консисторская, Преображенская, Юго-восточная, Юго-западная и Безымянная круглые.
Архитектурные сооружения (XVI-XIX вв.) - 5-и главый, 5-и апсидный Благовещенский кафедральный собор со следами внутренней фресковой живописи, построенный в 1556-1562 гг. псковскими мастерами Постником Яковлевым и Иваном Ширяем, Дворцовая (Сошествия Святого Духа) церковь 2-ой половине XVIII в., церковь Николы Ратного, братский корпус и руины Спасо-Преображенского собора XVI в., башня Сююмбеки 1645-1650 гг. (?) - пятиярусная композиция из 4-х и 8-и гранных объемов, завершенных 6-и гранным шатром высотой 58 м (одна из падающих башен мира с отклонением от вертикали 1,98 м), губернаторский дворец, построенный в 1842-1849 гг. по проекту архитектора К.А. Тона, А.И. Песке и М.П. Коринфского, присутственные места конца XVIII - начала XIX вв., гауптвахта середины XIX в., юнкерское училище с манежем XIX в., артиллерийский (пушечный) двор XVIII - XIX вв.
Казанский Кремль - уникальный целостный памятник истории и культуры, сохранивший следы 3-х градостроительных сеток: татарской, русской дорегулярной и европейской регулярной, продукт взаимодействия различных градостроительных и архитектурных культур: болгарской, золотоордынской, средневековой казанско-татарской, итальянской, русской, современной татарской.
Территория музея-заповедника является:
• местом расположения в XV-XVI вв. столицы Казанского ханства;
• наиболее северо-западной точкой распространения исламской культуры в мире и восточной — распространения памятников псковско-новгородского стиля;
• местом культового поклонения, паломничества мусульман и христиан к своим святыням;
• административным центром ТАССР (1920-1992 гг.), Республики Татарстан (с 1992 г.);
• местом, связанным с пребыванием здесь выдающихся личностей.
На территории музея-заповедника открыты экспозиции из фондов Государственного музея Республики Татарстан, ведется строительство собственных музеев и экспозиций. Ведутся археологические, геофизические, геологические, инженерные изыскания, восстанавливаются памятники древней архитектуры, возводится новое здание мечети Кул Шэриф в память о той, что была разрушена при взятии Казани в 1552 г., музеефицируются археологические объекты всех исторических периодов.