Музей-заповедник создан на основании постановления Кабинета Министров Республики Татарстан от 14.08.1992 г. № 459 «Об организации Билярского государственного историко-археологического и природного музея-заповедника в Алексеевском районе Республики Татарстан». Территория - 2477 га, число экспонатов основного фонда - 75538 единиц хранения.
В состав музея-заповедника входят:
Билярское городище (X в.- 1236 г.) - культурный слой экономического, политического и культурного центра Волжско-Камской Болгарии, одного из крупнейших городов Восточной Европы - города Биляра («Великого города») в пределах укреплений в виде вала и рва протяженностью около 11 км с остатками большого двухзального комплекса дворцовой (кафедральной) мечети (еще в XVIII в. исследователи отмечали остатки стен, столба-минарета и портала), «караван-сарая», жилого здания («дома феодала»), кирпичной бани, колодца. При помощи аэрофотосъемки здесь зафиксированы следы около 30 кирпичных зданий, древние улицы, кварталы, площади и водоемы.
Балынгузское (Горкинское II) городище (30-40-е гг. XIV в.) - культурный слой города с фундаментами мавзолеев XIII-XIV вв. и недостроенными оборонительными сооружениями в виде вала и рва. По преданиям и историческим сведениям известно, что на кладбище «Балынгуз» (XIII-XVI вв.) производилось захоронение знатных людей не только в период Золотой Орды, но и во времена Казанского ханства. Для охраны могил и мавзолеев, считавшихся святыми, за оврагом Торецкий еще в XVII в. располагалась татарская деревушка.
Святилище «Святой ключ» I («Хужалар Тау» («Гора господ»)) (IX-Х вв.). - языческое святилище, известное с IX-Х вв., почитается святым и является местом паломничества для всех - татар, русских, чувашей, марийцев. Паломники верят в целительную силу источника, здесь совершают различные обряды, читают молитвы, оставляют подношения.
Христианское кладбище с часовней-склепом выдающегося химика А.М. Бутлерова. деревня Бутлеровка (14 км к юго-западу от посёлка Алексеевского).
Историко-археологический музей. Село Билярск. Здесь хранится богатая коллекция билярских древностей, собранная в разные годы. В их числе, например, металлическая обложка книги, инкрустированная драгоценными камнями, бронзовый замок в виде барса, имеющий на боку красивую надпись с благопожеланиями на арабском языке, с именем мастера, золотое и серебряное трехбусиное височное кольцо с фигуркой водоплавающей птицы в центре, и многие другие предметы.
Дом-музей академика А.Е. Арбузова. Село Билярск. Дом перевезен из деревни Арбузов-Баран, где и родился будущий химик. В этом же помещении располагается экспозиция, посвященная научной деятельности A.M. Бутлерова - основателя казанской школы органической химии. Усадьба предков ученого находилась в селе Бутлеровка, расположенного близ Билярска.
Другие археологические памятники различных эпох (Николаев-Баранские I и II городища (X-XIII вв.), Горкинское I городище (X-XIII вв.), Больше-Тиганский могильник, оставленный достоверно древневенгерскими племенами, кочевавшими в VII-IX вв. между Волгой и Белой в пределах своей легендарной «Великой Венгрии»), а также природный ландшафт - луга, лесной массив по реке Малый Черемшан и его притокам.
Остатки архитектурных сооружений являются уникальным и практически единственным образцом болгарской архитектуры середины X - начала XIII вв.
Территория музея-заповедника является:
• местом культового поклонения, паломничества мусульман, христиан и язычников своим святыням;
• местом расположения в XII - начале XIII вв. столицы Волжско-Камской Болгарии - города Биляра (Великого города);
• местом, связанным с пребыванием здесь выдающихся личностей: в XVIII вв. академика Российской Академии наук Н.П. Рычкова, химиков А.М. Бутлерова, А.Е. Арбузова и других.
Территория музея-заповедника доступна для туристического показа. Доехать можно автобусами из г. Казани, Елабуги, Чистополя и других городов. Наиболее благоприятным временем для посещения памятников музея-заповедника являются апрель - октябрь. Музей открыт ежедневно в 9.00 до 18.00.
У святого ключа отрыт духовно-религиозный комплекс поклонения и отдыха «Изге чишмэ» для представителей всех конфессий. Для туристов, экскурсантов и паломников имеются места для совершения обрядов, магазины, стоянки для автотранспорта, места для отдыха.